L’histoire a lieu sur la ligne d’univers bêta où Okabe ne pouvait pas sauver Kurisu le 28 Juillet, et a fini par revenir seul.
6 mois plus tard, Okabe n’a plus goût à la vie et s’enferme sur lui-même. Son seul but est de poursuivre le travail réalisé par Kurisu…